学校现有校长、党委书记1人，副校长3人，工会主席1人，校长助理3人，学校实行党委领导下的校长负责制，负责学校全面工作，副校长分管人事劳资、教学、总务后勤、德育安全等工作，工会主席分管学校工会工作，校长助理协助校长分管学校其他工作。
随着学校规模不断扩大，为了更科学地发挥各部门的职能作用，更好地服务学校教育教学工作，学校设校党政办公室、教务处、教科室、德育安全法制处、总务处、体艺卫处、信息技术中心、团委、工会等九大办公室。
一、党政办公室
主要职责:负责处理学校党政办公室日常事务。安排学校行政工作日程、会议和其它活动。负责来电、来问、来函、来访接待和处理工作。负责学校印章的保管和使用及学校文书档案管理工作。负责学校全面性文件的草拟及校长办公会、行政会议记录工作。协调学校各部门之间的关系，完成校长和党委交办的其他各项任务。
具体分工：主任主管学校行政日常事务、人事组织、外来人员接洽、学校宣传、教师档案、评职晋级、政策解释、党务事宜等； 副主任协助主任做好学校日常事务，会议考勤、通知发放、津贴造表、教师事、病假统计、活动开展等； 具体做好教职员工的档案工作，做好教师日常教学上课考勤的统计工作。
工作要求：（1）遵守劳动纪律，按时上下班。（2）负责文件收发、管理，并按时交档案室归档。（3）协助办公室主任处理好日常事务，做好群众来信来访、资料搜集整理等工作。（4）与教务处、总务处配合，做好学年初报表和学校情况统计工作，及时上报学校领导或上级行政主管部门。（5）协助做好教职工劳动人事、工资、福利及离退休人员相关工作。（6）做好评优晋级所需有关资料的提供和相应送审材料的填报。（7）完成学校领导安排的其他临时性工作。
二、教务处
教务处现有主任1人、副主任1人,主任负责主持教务处的全面工作，加强学校的教育教学管理。制订实施全校教育教学工作计划，安排督促检查教师的教学工作和学生的学习情况，组织开展教学研究活动，指导辅助教研组工作，检查教师履行职责情况。负责招生、编班、编排课程表，作息时间表、课外活动表，负责学生学籍管理，深入教学第一线，每天巡课一至二次，听取了解师生对教育教学工作的反映，并及时交办学校急需解决的教学问题，抓好“一会”“两课”“两操”活动的开展,具体管理图书室、阅览室、油印室等日常工作。
教务干事负责收集、填报学校各种数据，汇总教育教学情况，负责年级组长、班级、班主任、教研组长、教师、职员、学生中的考核评比工作，并向学校提出奖惩意见,建立健全师生档案，收集好学校各种资料.
三、教科室
学校教科室负责认真贯彻党的教育方针，贯彻学校发展的办学思想，有效地开展教育科研工作，依靠全体教职工，集思广益，积极组织教育改革、教育科研，为教师的经验总结、成果交流与推广服务。为学校教育教学决策服务，为全面推进素质教育，全面提高教学质量服务。立足于教育教学研究与实践，发动全校师生建立、健全学校课题管理机制。
协助制定学校发展计划、教育科研工作规划与校内各项规章制度，协助做好师资队伍建设工作，负责教师继续教育工作的开展，负责推荐选送优秀教师参加高层次学历进修、骨干教师的选送和培训工作，建立名师工程制度，组织学校教师的教育理论和业务的培训。组织力量做好评教、评优工作。建立学校“传帮带”常规制度，促进中青年教师成长。组织落实青年教师“结对子”培养工作，定期检查活动进展情况，期末做出书面总结与评比验收，协助教务处组织全校公开课，研究课、优质课等的评比工作。负责全校的教育科研常规流程管理工作，加强对学校教师的教育科研的指导管理，组织国家级、市级、县级课题的论证、申报工作、审批，验收校级课题，编辑学校教育科研论文集。
编辑学校教研刊物。检查各项课题的进展与阶段成果，定期组织全校或校际教研成果交流，组织学校学术会，做好教育科研成果的评奖工作。了解、收集校内外的教育、教学研究与改革信息，定期向教师介绍先进教育理念和实践经验或聘请校外专家来校讲学。组织教科室工作人员做好各种资料的整理与归档工作。充分发挥教育科研在学生开放性活动，研究性学习课程中的作用，经常为举办学生科学研究、自主探索等方面的专题报告、讲座服务，加强与市内外兄弟学校和其他教育科研部门的联系，引进先进的办学经验，做好对外宣传工作。
四、德育安全法制处
德育安全法制处现有主任1人、副主任3人，主要工作职责是协助校长制定并实施学校的思想政治工作计划，检查和总结学校的教育工作。组织管理思想政治教育工作：贯彻执行上级有关德育工作的指示和条例，具体组织中学德育大纲的实施，切实抓好《中学生日常行为规范》的施行。领导和管理年级组和班主任工作，指导督促年级组和各班开展正常的活动。具体指导并检查各年级、各班级开展建设良好班集体活动，开好校会、班会和开展有益的丰富多彩的课外文体活动及竞赛，办好宣传画廊、板报、检查评比各班的黑板报工作，指导各班布置教室，优化育人环境。经常深入年级组、班级全面了解学生的思想动态，及时处理好偶发性事件，重大问题及时向校长汇报。
审查班主任工作计划，审定三好学生名单和文明班集体名单，审定学生发放奖学金的名单及金额。组织班主任及教师学习教育理论和业务进修，并检查学习和进修效果，及时交流。督促教师写好德育工作总结。协助校长室办好家长学校，指导班主任与家长加强联系，积极开展社区教育活动，建立好学校、社会、家庭三结合的教育网络。指导教师撰写好学生的操行评定，督促教师写好德育工作总结，组织开展新老班主任传帮互补活动，帮助新班主任熟悉业务。领导并指导学校宿务工作，协助总务处做好清洁卫生的思想发动、检查评比、督处教育工作。保持校容整洁、美观。协调好团、队、会的工作。团、队、会的工作纳入整个学校德育工作的一部分，负责学生的生活和纪律管理，组织开展“文明班级”、“文明宿舍”等活动。
五、总务处
总务处现有主任1人，副主任2人，主要加强财务、基建、校舍、国有资产等管理，直接服务于教育教学，为学校师生的学习、工作、生活服务。
负责制定总务工作计划和学校建设的长期规划，搞好教学用品的采购，保管和供应，配合教务处、德安处做好爱护公物教育。负责学校的基本建设，搞好房屋的维修、管理、使用，搞好校具的使用，管理和损坏赔偿，管好财物，杜绝浪费，做好学校经费的预算、决定，学生学杂费的收交工作，定期向校长报告，预算执行情况，合理使用各项同经费，定期公布账目，搞好师生生活福利，管好食堂、宿舍、用电、用水等福利事业，搞好校容、校貌和学校卫生工作，有计划绿化学校环境，开辟和管理好学校的花坛、草坪，美化环境，改善办学条件，并配合其他部门搞好学校的相关工作，加强对总务部门职工的思想、政治教育，端正服务态度，关心他们的业务进修和技术的提高，做到人尽其才，才尽其用，做好学校财务管理工作，对学校财经财产全面负责，按财经管理制度，管好用好学校有限的资金，把好财经使用关，严格执行财经纪律，认真编制预决财务报表，及时向领导汇报财经情况，严格审核收支凭据，及时公布帐目，做到日清月结，准确无误，认真做好会计档案的建立与管理工作，搞好学校各类财产的清理、登记、造册，做到学校财产心中有数，填好教职员工基本情况记载表，对学校各种资金的使用有监督管理责任。协助伙食团事务员管理好伙食团账目工作，随时为教学准备好所需物品、资料，严格按学校规定发放各种经费，报销各种发票，做好勤俭节约、勤工俭学工作。
六、信息技术中心
信息技术中心为了满足学校日益现代化的教育教学需要，努力建好数字校园，推进学校教育信息化工程，以服务、支撑为工作理念，加强现代教育信息技术中心自身建设，不断完善各项管理，使学校教育教学设施、设备更好地为教育教学服务，为课程改革服务。
信息中心现有主任1人，技术维护工作人员6人，同时兼任学校信息技术教学，主要工作内容：做好信息中心的各项资料与设备准备工作，对学校部分电脑、多媒体教室、机房、班班通进行维护调试。做好网站、广播电视宣传及相应的服务工作，配合学校各项活动的开展，做好音响、多媒体、摄像安装与调试工作。抓好电化教学与实验室的常规管理工作。进一步加强对学校闭路电视系统及电视直播系统进行了检修，确保学校重大活动的正常录像以及现场电视与网络直播，并挂到校园网服务器上。
做好学校的高考服务工作，配合教务处做好学生的综合素质评定工作。做好各种考试的前期准备工作，管理维护升级学校的广播系统、监控系统、电视系统、网络系统、电路系统。
七、体艺卫处
学校体育卫生工作和艺术教育是学校教育工作的重要组成部分，是素质教育不可缺少的重要内容。体卫艺处及主任工作开展有如下几点：在校长、分管体卫艺的副校长的领导下，抓好学校的体育卫生工作和艺术教育工作，加强管理督促、检查和落实工作；认真贯彻落实《学校体育工作条例》、《学校卫生工作条例》、《学校艺术教育总体规划》，以及其它有关体卫艺工作文件精神；制定体卫艺工作计划、规章制度，并执行落实；负责统一管理体卫艺各类资料、文件、档案和存档； 负责检查、体育组、美术组、音乐组、校医室以及各运动队和艺术队的工作计划、工作总结；收集每学年各年级施行《国家体育锻炼标准》、《体育合格标准》的统计材料，做好学生体质健康监测，建立学生体育达标档案；合理安排早操、课间操、课外文体活动，抓好两操一课质量，加强检查、评比和指导；组织体育组、音乐组办好一年一度的校运会和文娱晚会，抓好校医室完成每年一次全校学生体检工作，建立学生健康档案；抓好体育代表队和艺术队的训练和管理，组织队伍参加县市各类比赛；协助体育组、美音组、校医室抓好中考体育生、艺术生训练工作，初中毕业生的体检；做好中学生常见疾病和传染病的防治工作，加强卫生保健知识宣传；抓好健康教育，增强学生的卫生意识，养成卫生习惯；搞好阳光体育运动；指导体育、艺术组、校医室抓好体卫艺方面的科研工作，总结交流经验，不断提高业务水平；完善体育、艺术以及卫生硬件照册设施的建设，定期检查维修，做好体育、音乐、美术器材的管理；完成校领导安排的其他工作。
八、团委
共青团重庆市酉阳第一中学校委员会是在校党委领导、团县委的指导下的先进青年的群团组织，是全校团员青年在实践中学习共产主义的青年先锋队。
加强青年学生的思想政治教育工作。从实际出发，组织学习马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”重要思想、科学发展观及习近平新时代中国特色社会主义思想；学习党的路线、方针和政策；学习科学文化知识和业务知识。宣传、执行团县委和校党委的指示和决议，参与民主管理和民主监督，充分发挥团员的先锋模范作用，团结和带领青年学生开展各种有益身心健康的活动，促进我校学风、校风建设。维护青年学生的正当权益，了解和反映他们的思想、要求，关心他们的学习、生活和休息，充分发挥学校行政联系青年学生的桥梁与纽带作用。加强对本校团员的教育和管理，做好团委的常规性工作。立足本校团委工作实际情况，密切同各兄弟学校、团组织的联系。
主要工作：根据上级团组织的工作要求，围绕学校中心工作，结合实际情况，制订团的工作计划，召开全委会、团委扩大会议，研究决定团内重大事宜；建立健全团的工作制度，负责审批新团员入团和超龄团员退团等工作，做好团费的收缴、管理、使用工作，管理团内文书和团籍档案；健全和执行团的组织制度。利用业余党校、业余团校对广大团员青年及入团积极分子进行教育培训。配合党组织做好“推荐优秀团员作为党的发展对象”工作；组织开展学生社会实践活动、青年志愿者活动、第二课堂活动；开展丰富多彩的校园文化活动，并负责指导学生社团工作；极做好团的宣传工作。负责学校广播站及校刊编辑工作；深入班级，了解情况，检查和指导团支部工作，掌握青年的思想动态，培训团的干部，交流团的工作经验；配合学生科和班主任做好学生的管理工作；指导并具体帮助学生会开展各项工作，充分发挥学生会的工作能力。
九、工会
学校工会紧紧围绕党委的中心工作，根据党委和上级工会的工作部署，制定工会工作计划，发挥工会全体委员的作用，布置、检查、指导各基层小组开展工作；贯彻《教师法》、《教育法》和《工会法》，努力维护教职工合法权益，为群众说话办事，沟通领导与教职工的联系，做好上情下达、下情上达的工作。
自觉履行教育职能，发挥工会的自身特点和优势，协助党委做好教职工的思想政治教育工作，经常开展爱国主义、社会主义、集体主义和公共道德、职业道德、家庭道德的教育，积极开展有益于精神文明和校园文化建设的各类教育活动，全面提高教职工的综合素质。按期组织召开工会会员代表大会，主持起草工作报告，并向大会报告工作。切实履行民主参与职能，组织和代表教职工参与学校民主管理和民主监督，充分发挥工会在民主渠道和教代会工作机构的作用；认真落实教代会的职权，教代会筹备工作和会务工作的开展。着力履行维护职能，发挥工会桥梁纽带作用，不断促进教职工工作、生活条件的改善。重视从源头上维护教职工的正当权益，参与学校有关改革与发展的重大问题讨论。维护女职工的特殊利益，积极开展女教职工委员会工作。组织好群众性文体活动，充分利用教工之家等活动场所，搞好群众性的文化娱乐、体育活动，更好地丰富教职工的文体生活，使教职工在各项活动中陶冶情操，增长知识。关心群众生活，做好教职工集体福利工作。加强工会组织的自身建设，努力提高工会干部的综合素质。